下丘脑性闭经患者通常在激素六项检查中，表现为下丘脑性闭经患者通常表现为促卵泡激素（FSH）、黄体生成素（LH）、雌二醇（E2）、孕酮（P）、催乳素（PRL）和睾酮（T）水平均低于正常范围。
正常的月经是由中枢神经系统、下丘脑-垂体前叶和卵巢功能之间相互调节而控制的。任何因素直接或者间接影响下丘脑-垂体功能，导致下丘脑分泌促性腺激素的释放，以及垂体前叶分泌促性腺激素的功能低下或紊乱，从而影响到卵巢功能，引起三个月以上的停经，就称为下丘脑闭经。当患者存在下丘脑性闭经时，身体激素紊乱，会导致激素六项检查指标不正常。这是因为下丘脑受损导致无法正常释放促性腺激素，进而影响卵巢的功能，从而导致激素水平的下降。下丘脑性闭经可能是长期的精神压抑、紧张忧虑，甚至是环境改变、过度劳累等引起。
需要注意，激素六项检查结果仅为判断的一部分，不能单独作为诊断下丘脑性闭经的依据。因为其他疾病或药物也可能导致激素水平的异常变化。
