- 云南省第一人民医院
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：血液内科、临床护理、老年病科、产科、儿科、神经内科、胸外科、妇科、内分泌科、消化内科、神经外科、呼吸内科、心内科、普通外科、医学影像科、麻醉科、肿瘤科、泌尿外科、风湿免疫科、骨科、病理科、口腔颌面外科、生殖遗传科
- 云南大学附属医院（云南省第二人民医院、云南省眼科医院）
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：普通外科、康复医学科、眼科、急诊医学部、重症医学科、骨与创伤外科、神经外科、产科、生殖医学、内分泌科、神经内科、疼痛科、感染性疾病、肝病内科、呼吸与危重症医学科、消化内科、血管外科、医学影像科、口腔医学
- 云南省第三人民医院
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：老年医学科、职业病科、妇科、产科、肝胆胰外科、普外科、骨科、疼痛科、麻醉科、消化内科、内分泌科、康复医学科、医学影像科、医学检验科、护理、儿科、肺科、重症医学科、职业病、血液科
- 昆明市第一人民医院
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：器官移植、神经外科、骨科、心内科、老年病科、麻醉科、普外科、临床护理、检验科、呼吸内科、肝胆胰外科、神经内科、重症医学科、临床药学部、呼吸内科
- 昆明市延安医院
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：心脏大血管外科、骨科、麻醉科、心血管内科、普通外科、神经外科、泌尿外科、神经内科、内分泌科、肾病学科、妇科、产科、儿科、眼科、口腔科、全科医学科、呼吸与危重症医学科
- 昆明同仁医院
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：心血管内科、脊柱脊髓科、神经外科、急诊医学科、重症医学科、康复医学科
- 中国人民解放军联勤保障部队第九二〇医院
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：骨科、 颅脑脊髓外科、神经外科、心血管内科、急诊医学科、康复医学科
- 安宁市第一人民医院
三级甲等云南昆明市
- 重点科室：疼痛科、医学影像科、疼痛科脊柱源性疼痛专业、急诊医学科、心血管内科、骨科、呼吸内科、消化内科、医学检验科、精神科、内分泌科、普外科、神经内科、肾内科、胸外科、重症医学科、医学检验科
- 玉溪市人民医院
三级甲等云南玉溪市
- 重点科室：神经外科、神经内科、心内科、骨科、重症医学科、内分泌科、儿科、妇产科、急诊科
- 腾冲市人民医院
三级甲等云南保山市
- 重点科室：骨科、妇产科、心血管内科、传染科、内分泌科、麻醉科、神经内科、消化内科、康复医学科
- 普洱市人民医院
三级甲等云南普洱市
- 重点科室：神经外科、心胸外科、神经内科、心血管内科、肾内科、血液风湿免疫科、泌尿外科、重症医学科、急诊医学科、妇产科、儿科、感染性疾病科、康复医学科、心脏大血管外科、胃肠外科、病理科、肝胆外科、肿瘤科、消化内科、骨科
- 云县人民医院
三级甲等云南临沧市
- 重点科室：妇科、产科、普通外科（肝、胆、胰、肠胃外科）、心血管内科、儿科、骨科、麻醉科
- 楚雄彝族自治州人民医院
三级甲等云南楚雄彝族自治州
- 重点科室：心血管内科、儿科、急诊医学科、普通外科、重症医学科、骨科、麻醉科、神经内科、泌尿外科、肾内科、胸心外科、感染性疾病科、妇产科、眼科、耳鼻喉科、超声医学科、口腔全科
- 红河州第一人民医院（云南省滇南中心医院）
三级甲等云南红河哈尼族彝族自治州
- 重点科室：骨科、急诊医学科、心血管内科、重症医学科、妇产科、临床护理、神经内科、神经外科、消化内科、感染科、普通外科、医学检验科、口腔科、呼吸与危重症医学科、泌尿外科、康复医学科、疼痛科
- 个旧市人民医院(红河州滇南中心医院)
三级甲等云南红河哈尼族彝族自治州
- 重点科室：中医科、妇产科、骨科、内分泌科、普通外科、神经内科、产科、肾内科、关节创伤科、脊柱创伤科、心血管内科、儿科
- 联勤保障部队第九二六医院
三级甲等云南红河哈尼族彝族自治州
- 重点科室：骨科、消化内科、眼科、烧伤科、口腔颌面外科
- 大理白族自治州人民医院
三级甲等云南大理白族自治州
- 重点科室：呼吸与危重症医学科、临床护理、急诊医学科、普外科、心内科、骨科、泌尿外科、妇产科、老年病科、神经内科、感染性疾病科、肿瘤科、儿科、重症医学科、医学影像科、胸外科、病理科
- 大理大学第一附属医院（云南省第四人民医院）
三级甲等云南大理白族自治州
- 重点科室：神经外科、康复医学科、神经内科、医学检验科、重症医学科、呼吸内科、老年病科，普外科、麻醉科、心血管内科、血液科、皮肤科、骨科、病理科、眼科
- 祥云县人民医院（大理白族自治州第三人民医院）
三级甲等云南大理白族自治州
- 重点科室：护理学、呼吸内科、消化内科、骨科、儿科、眼科、神经内科、感染科、麻醉科、康复科、耳鼻咽喉科、口腔科
- 德宏州人民医院
三级甲等云南德宏傣族景颇族自治州
- 重点科室：儿科、泌尿外科、临床护理、妇产科、骨科、老年病科、风湿病科、肛肠科、康复科、心血管内科、神经外科、超声科