- 安徽医科大学第一附属医院
三级甲等安徽合肥市
- 重点科室：皮肤性病科、神经内科、呼吸内科、中西医结合肿瘤科、泌尿外科、儿科、普外科、心血管内科、内分泌科、感染病科、风湿免疫科、妇产科、消化内科、心脏外科、神经外科、肿瘤内科、肾脏内科、整形外科、眼科、骨科、普胸外科
- 安徽医科大学第二附属医院
三级甲等安徽合肥市
- 重点科室：呼吸与危重症医学科、血液内科、眼科、重症医学科、肿瘤科、麻醉与围术期医学科、骨科、泌尿外科、肾脏内科、儿科、检验科、耳鼻喉、头颈外科、神经内科、整形与创面修复外科
- 安徽省第二人民医院
三级甲等安徽合肥市
- 重点科室：消化内科、妇产科、眼科、职业病科、放射科、呼吸与危重症医学科、神经内科、心血管内科、普外科、肝胆胰血管、胃肠、、甲乳、肝胆胰、胃肠、骨科、肿瘤科、康复医学科、麻醉科
- 合肥市第一人民医院（安徽医科大学第三附属医院）
三级甲等安徽合肥市
- 重点科室：护理学、骨科、关节骨科、脊柱骨科、创伤骨科、心血管内科、老年医学科、肿瘤科、血液肿瘤科、放射医学科、临床药学、中医科肛肠科、肝胆胰外科、肾脏内科、神经外科
- 合肥市第二人民医院
三级甲等安徽合肥市
- 重点科室：神经内科、心血管内科、骨科、关节骨科、脊柱骨科、创伤骨科、泌尿外科、重症医学科、介入放射科、康复医学科、呼吸内科、耳鼻咽喉、头颈外科、普通外科、胸心外科、内分泌科、全科医学科、病理科、护理学、超声医学科
- 中国人民解放军联勤保障部队第九〇一医院
三级甲等安徽合肥市
- 重点科室：妇产科、神经外科、生殖医学中心、消化内科、肿瘤科、感染科、心血管内科、急诊医学科、骨科、泌尿外科、全科医学科、耳鼻咽喉、头颈外科
- 中国人民武装警察部队安徽省总队医院
三级甲等安徽合肥市
- 重点科室：普外科、肾脏内科、麻醉科、泌尿外科、骨科、神经内科、胸外科、康复医学科
- 淮北市人民医院
三级甲等安徽淮北市
- 重点科室：心血管内科、妇产科、妇科、产科、医学影像科、神经内科、消化内科、皮肤性病科、耳鼻咽喉头颈外科、眼科、骨科、口腔科、重症医学科
- 淮北矿工总医院
三级甲等安徽淮北市
- 重点科室： 肿瘤科、心脏大血管外科、检验科、血管内科、神经外科、骨科、妇产科、泌尿外科、血液科、神经内科、重症医学科、医学影像科、精神心理科、内分泌科、风湿免疫科
- 亳州市人民医院（安徽医科大学附属亳州医院）
三级甲等安徽亳州市
- 重点科室：耳鼻咽喉、头颈外科、心血管内科、呼吸与危重症医学科、神经内科、儿科、骨科、重症医学科、普通外科、胃肠外科、肝胆外科、甲状腺外科、乳腺外科、肛肠外科、妇产科、妇科、产科、生殖医学科、产前诊断中心、全科医学科、内分泌科、麻醉科、护理学、急诊医学科、血液内科、老年医学科
- 宿州市立医院（安徽医科大学附属宿州医院）
三级甲等安徽宿州市
- 重点科室：神经内科、消化内科、泌尿外科、骨科、关节外科、内分泌科、急诊医学科、全科医学科、心血管内科、普通外科、肿瘤内科
- 蚌埠医科大学第一附属医院（蚌埠医科大学附属肿瘤医院）
三级甲等安徽蚌埠市
- 重点科室：呼吸与危重症医学科、骨科、肝胆胰外科、胃肠外科、血管外科、检验科、肿瘤外科、肿瘤放疗科、肿瘤内科、肿瘤妇科、心血管科、急诊外科、急诊内科、康复医学科、眼科、胸外科、神经外科、重症医学科、消化内科、耳鼻咽喉头颈外科、口腔颌面外科、中医科疼痛麻醉科、药剂科、神经内科、风湿免疫科、内分泌科、整形外科（含烧伤外科）
- 蚌埠医科大学第二附属医院（上海市第一人民医院蚌埠医院）
三级甲等安徽蚌埠市
- 重点科室：妇产科、妇科、产科、骨科、神经外科、普通外科、泌尿外科、肿瘤外科、重症医学科、整形烧伤外科
- 蚌埠市第三人民医院（蚌埠市中心医院）
三级甲等安徽蚌埠市
- 重点科室：烧伤整形科、神经外科、神经内科、消化内科、皮肤科、麻醉科、中西医结合科、全科医学科、超声医学科、心血管内科、骨科、泌尿外科、肝胆外科、甲乳外科、胃肠外科、血管外科、妇产科、儿科、重症医学科、急诊科、肾脏内科、血液内科、肿瘤内科、呼吸与危重症医学科、临床药学科、护理部
- 蚌埠市第一人民医院（蚌埠市儿童医院）
三级甲等安徽蚌埠市
- 重点科室：儿科、消化内科、新生儿科、呼吸内科、心血管内科、泌尿外科、普通外科、骨科、胸心外科、整形外科、妇产科、康复医学科
- 阜阳市人民医院
三级甲等安徽阜阳市
- 重点科室：骨科脊柱与创伤、骨科关节与创伤、骨科手外显微、骨科运动与关节镜、妇科、产科、生殖医学科、耳鼻喉头颈外科、康复医学科、心血管内胸心外科、神经外科、胸外科、肿瘤科、放疗科、血液科、普外科、儿科、眼科、泌尿外科、神经内科、内分泌科、消化科、麻醉科、急诊科、呼吸内科、肾内科、重症医学科、临床药学、核医学科、病理科、中西医结合科、皮肤科、全科医学科、老年病科一病区、老年病科二病区、烧伤整形创面外科、感染科、医疗美容科、口腔科、中西医肛肠科、风湿科、疼痛科、儿外科、
- 安徽理工大学第一附属医院（淮南市第一人民医院）
三级甲等安徽淮南市
- 重点科室：眼科、神经内科、普外科、胃肠外科、肝胆胰外科、血管外科、妇产科、骨科、心血管内科、肾脏内科、老年医学科、神经外科、内分泌科、放射科、儿科重症医学科、烧伤整形科、感染性疾病科、风湿免疫科、消化内科、血液内科
- 滁州市第一人民医院（安徽医科大学附属滁州医院）
三级甲等安徽滁州市
- 重点科室：心血管内科、神经外科、医学影像科、骨科（含脊柱·关节·运动医学）、普外科（含胃肠·肝胆胰脾·甲乳）、血液内科、肿瘤科、呼吸与危重症医学科、血管外科、神经内科、检验科、妇产科（含妇科·产科）、介入血管科、儿科（含儿内科·新生儿科·儿童保健）、麻醉科、老年医学科、胸外科（心胸外科）、耳鼻喉科（耳鼻咽喉科）、临床护理、眼科、口腔科（口腔医院）、重症医学科、中医科（中西医结合科）、临床药学、小儿外科、全科医学科
- 六安市人民医院
三级甲等安徽六安市
- 重点科室：神经内科、肿瘤科、儿科、急诊医学科、骨科、病理科、临床药学、肾内科、血液内科、内分泌科、消化内科、心血管科、妇产科、神经外科、小儿外科、胸心外科、烧伤整形科、康复医学科、影像科、临床护理学、麻醉科、输血科、检验科
- 六安市第二人民医院（六安市精神病医院）
三级甲等安徽六安市
- 重点科室：普外科、精神科、神经内科、骨科中心、心血管内科、神经外科、消化内科、妇产科、儿科、康复医学科【儿童康复】、超声医学科、医学影像中心、医学检验科、护理部