- 江西中医药大学第二附属医院
三级甲等江西南昌市
- 重点科室：皮肤科、妇科、骨伤科、针灸科、脾胃病科、儿科、肺病科、肛肠科、中西医结合妇产科
- 赣州市中医院
三级甲等江西赣州市
- 重点科室：骨伤科、肛肠科、针灸康复科、治未病科、肾病科、脾胃病科
- 玉山县中医医院
三级甲等江西上饶市
- 重点科室：骨伤科、中风病科（脑病科）、肛肠科肺病科（肺科）、脾胃病科（脾胃科）、康复科、耳鼻喉科
- 宜春市中医医院
三级甲等江西宜春市
- 重点科室：针灸科、疮疡科、中医康复、治未病中心、老年病科、骨伤科（骨伤中心、脊柱骨科、关节骨科）、创伤科、中风病科、脾胃病科、肺病科、心血管内科、妇产科、儿科
- 泰和县中医院
三级甲等江西吉安市
- 重点科室：肝病科、骨科、心血管科（心病科）、脑病科（神经内科）、肺病科（呼吸内科）、肾病科（肾内科）、肿瘤科、脾胃病科（消化内科）、治未病科
- 萍乡市中医医院
三级甲等江西萍乡市
- 重点科室：神志病科、内分泌科、康复科、脑病科、肿瘤科、心血管科、脾胃病科、肾病科、肝胆科、椎间盘病科、骨伤科
- 新余市中医院
三级甲等江西新余市
- 重点科室：妇产科、脾胃科、针灸康复科、肛肠科、眼耳鼻喉科、脊椎科、胃脘痛、慢性肾衰、消化内科、乳腺病、中风病科、骨伤科、肾病科
- 鹰潭市中医院
三级甲等江西鹰潭市
- 重点科室：眼科、推拿科肺病科、针灸科、儿科、急诊科、骨伤科（脊柱病科、关节方向）、脑血管科／中风病科、消化科／脾胃病科、口腔科、妇产科、外科（普外・疝外科）肛肠科
- 福州市第一总医院
三级甲等福建福州市
- 重点科室：妇科、产科、肛肠科、中西医结合肿瘤科、心血管内科、呼吸内科、儿科、小儿内分泌科、消化内科，新生儿科、肾内科、中西医结合肿瘤科、中西医结合消化专科、中西医结合心血管专科、中西医结合糖尿病专科、皮肤科、整形外科、中医皮肤科、中西医结合脑瘫专科、小儿外科
- 福建省第二人民医院
三级甲等福建福州市
- 重点科室：脾胃病科、神志病科、肾病科、肛肠科、康复科、脑血管科、呼吸科、中医妇科、心衰专病、乳腺科、治未病科、护理学科、风湿内分泌科、脑病科、针灸科
- 福州市中医院（福州市人民医院）
三级甲等福建福州市
- 重点科室：神志病科、妇科（孙氏妇科）、儿科（陈氏儿科）肛肠科（邓氏肛肠科）、脾胃病科、糖尿病科（内分泌科）、药膳食疗科、治未病科、中药临床药学（药学部）、骨伤科（脊柱骨科／创伤骨科／骨关节与运动）、呼吸与危重症医学科
- 厦门市中医院(厦门华侨医院）
三级甲等福建厦门市
- 重点科室：儿科、肝病科、肛肠科、骨伤科、慢性胃炎、风湿病科、糖尿病、脾胃科
- 泉州市中医院
三级甲等福建泉州市
- 重点科室：针灸科、 中西医结合脑血管病专科、脑病科、中医妇科、中医肾病科、中医肛肠专科、中医骨伤专科、康复科中医外科、蛇伤科、脾胃肝胆科、心血管内科、治未病科、推拿科
- 晋江市中医院
三级甲等福建泉州市
- 重点科室：脾胃病科、肿瘤科、中医护理学、针灸康复科、针灸科、康复医学科、皮肤科、产科、妇产科、骨伤科、治未病科、重症医学科、内分泌科、中医儿科、肛肠科、风湿病科
- 安溪县中医院
三级甲等福建漳州市
- 重点科室：针灸康复科、脾胃病科、骨伤科、肛肠科、治未病科、老年病科、脑病科、心病科
- 福建省漳州市中医院
三级甲等福建漳州市
- 重点科室：骨伤科、运动医学专科、创伤中心、针灸科、推拿科、康复医学科、糖尿病专科、呼吸与危重症医学科、妇科、心血管科、中医护理、中药制剂、肛肠科、脾胃病科、脑病科
- 三明市中西医结合医院(三明市第三医院)
三级甲等福建三明市
- 重点科室：耳鼻喉科、儿科、含儿童保健科、哮喘专科、骨伤科、中西医结合骨伤康复、神志病科、传染病科、急诊外科、脑病科、康复科、肛肠科、心血管内科、消化内科、肿瘤综合治疗科、妇产生殖科
- 南平市人民医院
三级甲等福建南平市
- 重点科室：妇科、妇产科、不孕症科、脾胃病科、肾病科、心血管病科、脑病科、肛肠科、骨伤科、康复科、针灸科、推拿科
- 厦门大学附属龙岩中医院
三级甲等福建龙岩市
- 重点科室：脾胃病科、针灸科、骨伤科、治未病科、中医护理学、儿童康复、肾病科、康复科、针灸科、心血管科、脑病科、肛肠科、肿瘤科、妇产科、妇科、产科
- 福建中医药大学附属宁德中医院
三级甲等福建宁德市
- 重点科室：脾胃病专科、儿科、骨伤科椎间盘突出、中医肾病科、中医针灸科、中医肛肠科、中医结石病科、中医不孕症专病、中医膝关节