- 江苏省中医院（南京中医药大学附属医院）
三级甲等江苏南京市
- 重点科室：脾胃病科、肾科、儿科、耳鼻喉科、护理学、急诊科、心血管科、肺病科、妇科、肿瘤科、骨伤科、肛肠科、针灸科、临床药学、肛肠科、内分泌科、血液内科、推拿科、泌尿外科、男科、乳腺病科、老年医学科
- 南京市中医院（南京中医药大学第三附属医院）
三级甲等江苏南京市
- 重点科室：肛肠科、脑病科、心血管病科、妇科、肿瘤科、护理学、治未病中心、感染性疾病科、神志病科、骨伤科、针灸科、老年病科、急诊科、眼科、运动医学科、脾胃病科、肾病科、内分泌科、养生康复科、普外科 、甲状腺乳腺疝外科
- 江苏省第二中医院（南京中医药大学第二附属医院）
三级甲等江苏南京市
- 重点科室：肺病科、康复科、针灸科、脾胃病科、骨伤科、肛肠科、治未病科
- 南京市中西医结合医院
三级甲等江苏南京市
- 重点科室：中医外科、儿科、妇科、妇产科、脾胃病科、骨伤科、急诊科、肛肠科、肺病科、内分泌病科、心血管病科、重症医学科、医学检验科、针灸科
- 苏州市中医医院
三级甲等江苏苏州市
- 重点科室：脾胃病科、内分泌科、妇科、骨伤科、肛肠科、肛肠科、肺病科、肿瘤科、脑病科、肾病科、心病科、风湿病科、血液病科、普外科、泌尿外科、血管外科、针灸科、康复科、治未病科、儿科、皮肤科、急诊科、重症医学科
- 昆山市中医医院
三级甲等江苏苏州市
- 重点科室：脾胃肝胆科、重症医学科、妇产科、骨伤科、急诊科、肿瘤科、肾病科、胃肠外科、泌尿外科、产科、心血管科、脑病外科、甲乳外科、口腔科、眼科、肝胆外科、检验科、超声科、放射科
- 张家港市中医医院
三级甲等江苏苏州市
- 重点科室：耳鼻喉科、肾病科、妇科、肛肠科、肺病科、骨伤科、脾胃病科、康复科、医学影像科、内分泌科、肿瘤科、眼科、临床护理、儿科、脑病科、糖尿病、风湿病、康复科、妇产科
- 常熟市中医院
三级甲等江苏苏州市
- 重点科室：肛肠科、骨伤科、肾病科、肿瘤科、妇产科、儿科、脾胃病科、心血管科
- 无锡市中医医院
三级甲等江苏无锡市
- 重点科室：心血管科、骨伤科、肿瘤科、肛肠科、治未病科、脑病科、推拿科、肾病科、风湿病科
- 常州市中医医院
三级甲等江苏常州市
- 重点科室：心血管病科、骨伤科、肾病科、脾胃病科、肿瘤科、妇科、产科、脑病科、肛肠科、肺病科、内分泌科、风湿病科、针灸科、推拿科、口腔科
- 常州市武进中医医院
三级甲等江苏常州市
- 重点科室：骨伤科、儿科、康复医学科、心血管病科、肾病科、肛肠科、脑病科、肺病科、妇科、脾胃病科、针灸推拿科、急诊科、泌尿外科、乳腺病科
- 镇江市中医院
三级甲等江苏镇江市
- 重点科室：脾胃病科（消化科）、妇科、肿瘤科、肾病科、脑病科（康复科）、肛肠科、眼科、肺病（呼吸）科、心血管病科、儿科
- 南通市中医院
三级甲等江苏南通市
- 重点科室：中医外科、脾胃病科、骨伤科、妇科、肺病科、肾病科、内分泌、风湿病科、针灸科、儿科、肛肠科、脑病科、心病科、肿瘤科、药学部
- 泰州市中医院
三级甲等江苏泰州市
- 重点科室：骨伤科、脑病科、眼科、脾胃病科、肾病科、心血管病科、肿瘤科、肛肠科、儿科、妇产科、针灸推拿科、风湿病科、肺病科、内分泌病科、耳鼻喉科、泌尿外科、康复科、重症医学科、检验科
- 徐州市中医院
三级甲等江苏徐州市
- 重点科室：皮肤科、心血管科、针灸、脑病科、康复医学科、肛肠科、风湿科、中医外科、骨伤科、肾病科、脾胃病科、内分泌科、呼吸内科、肿瘤内科、妇科、推拿科、医学检验科、病理科、老年医学科、普外科
- 邳州市中医院
三级甲等江苏徐州市
- 重点科室：儿科、针灸科、康复科、肝病科、肛肠科、脑病科、肿瘤内科、肺病科、脾胃肺病、骨伤科
- 连云港市中医院
三级甲等江苏连云港市
- 重点科室：针灸科、脑病科、肛肠科、肾病科、康复科、泌尿外科、消化科、结石科、医学影像科、 骨伤科、心血管病科、妇科、儿科、肺病科、肿瘤科、糖尿病科、眼科、脾胃肝胆科
- 淮安市中医院
三级甲等江苏淮安市
- 重点科室：肛肠科、心血管病科、肾病科、脑病科、肿瘤科、康复科、内分泌科、妇产科、肺病科、耳鼻咽喉科、骨伤科、针灸科、脾胃病科、老年病科、治未病科、推拿科、儿科
- 盐城市中医院
三级甲等江苏盐城市
- 重点科室：儿科、肿瘤科、脾胃内科、骨伤科、脑病（针灸）科、心血管内科、肛肠科、肝胆内科、胸外科、内分泌科、肺内科、肾病科、急诊科、中医外科、妇科、皮肤科、康复科、中药学、治未病科、护理学科
- 宿迁市中医院
三级甲等江苏宿迁市
- 重点科室：肛肠科、脑病科、骨伤科、脾胃病科、儿科、泌尿外科、肿瘤科、肾病科、妇科、针灸科