临床主要用于治疗痛风、类风湿关节炎、病窦综合征等病症。

1.痛风：纳入60例慢性痛风性关节炎患者，中药治疗组及西药对照组各30例。西药对照组口服别嘌醇、美洛昔康；中药治疗组服用加味桂枝附子汤。疗程为3周。结果：中药治疗组临床治愈率为20%，总有效率为83.3%，对照组临床治愈率23.3%，总有效率为86.7%，治疗组在改善血脂异常、降低血沉、C反应蛋白方面优于对照组，改善关节肿胀、功能等方面优于对照组。西药对照组则能有效降低血尿酸、减轻关节疼痛。(广州中医药大学，2009年)

2.类风湿关节炎：将符合标准的60例患者随机分成治疗组、对照组各30例，对照组：益赛普25毫克，每周2次(隔3日)，第3个月改为25毫克，每周1次，皮下注射。治疗组在对照组基础上加用桂枝附子汤，观察12周。结果：治疗组在改善临床症状、炎性指标、疾病活动度、ACR标准评估以及临床总疗效方面均优于对照组。(《广州中医药大学学位论文》2013年)

3.病窦综合征：本方加生脉散治疗患者40例，结果：桂枝附子汤合生脉散加减方以温补心肾，益气活血之法。以阳药为主。辅以阴药，阴能助阳，阴能制阳，共奏温阳益气、活血散寒之功，且避久服阳燥之虞。使其中医证候疗效达90%，病窦疗效达85%。(《医药论坛杂志》2011年第18期)