蜈蚣，虽然性有毒，但更善解毒，古人认为它“凡一切疮疡诸毒皆能消之”。亦善搜风，内可治肝风萌动，癫痫眩晕，抽掣瘛?，小儿脐风；外可治经络中风，口眼歪斜，手足麻木。又治蛇咬中毒。蜈蚣还因其息风解痉之效而常用于中风痉搐、百日痉咳；因祛毒治疮之效而常用于炎肿疮疡、骨髓炎、甲沟炎等。张锡纯对它的评价是：走窜之力最速，内而脏腑，外而经络，凡气血凝聚之处皆能开之。
其实，关于蜈蚣酒，还有一个有趣的故事。有一个噎膈患者，看了不少医生，喝了不少药，始终无效，令他心灰意冷，终日借酒浇愁。没想到一坛酒喝完之后，这多年的宿疾竟然不药而愈，这让他好生疑惑。直到酒缸见底之后，竟然在里面发现了一条不知何时爬进去的大蜈蚣，才恍然大悟——病证之向安，正是在于这酒中蜈蚣！这故事载录在张锡纯的《医学衷中参西录》中。医家分析蜈蚣愈疾之理，“盖噎膈之证，多因血瘀上脘，为有形之阻隔，蜈蚣善于开瘀，是以能愈。”还由此领悟到“治噎膈者，蜈蚣当为急需之品矣。”
噎膈，相当于现代的食管癌、胃癌等恶性肿瘤。今人治癌，蜈蚣亦多用之。有报道，胃癌，用蜈蚣5条，三棱、莪术、枳实各12克，海藻、昆布各15克，水蛭24克，银花90克，水煎3次分服，用白糖调味。开始服用时或有恶心、闷胀等副作用，继续应用可以缓解。坚持6个月，可使胀痛等症状消失，肿块软缩，溃疡平复，病情显著好转。
食管癌，用蜈蚣5条，全蝎6克，大枣5枚，半夏、沙参、旋覆花、鸡内金各9克，山药15克，夏枯草、紫草根、白茅根、蛇舌草各30克，半枝莲60克，水煎3次，合并煎液，加蜜糖浓缩，分3次服用。
又如乳腺癌，蜈蚣2条，蜂房、海藻、昆布、天花粉各9克，土贝母、元参各15克，牡蛎、夏枯草各30克，水煎2次分服。
另有报道，蜈蚣晒干，研成粉末，每日量约2~3条，分次服。分别用于治疗胃癌、食道癌、肺癌、乳腺癌、皮肤癌、唇腺癌、子宫颈癌，观察发现，蜈蚣对于癌肿溃疡患者疗效较明显，多在用药后1月内见到溃疡明显缩小。蜈蚣用量最多有每日用至6条者，亦未见到毒性反应。
《新中医》曾介绍名中医刘伟胜教授运用全蝎、蜈蚣治疗恶性肿瘤的经验，认为全蝎、蜈蚣解毒散结，熄风止痉，临证治癌宜灵活辨证，结合二药药理，以增强抗癌抑癌之力，审时度势，使用时应把握其用量、用法及用药时间，适可而止。
这里还要提一提《本草中国》中出现的蜈蚣炮制，其法十分特别，其中有一个环节是要用竹签将其首尾撑开，使之定型为细细长长的一根，晒干后再将竹签取出，蜈蚣就保持为这样的形状了。只见熟练的工人将定型之后的蜈蚣一根根捉起，抽去竹签，凑成一捆后包起来，就完成了蜈蚣的炮制。不仔细看，还以为是一捆捆的棉签，谁能想到在医者手中竟是应对各种癌症的法宝！