临床主要用于治疗寒湿泄泻、功能性消化不良、儿童功能性再发性腹痛、慢性胃炎等病症。

1.寒湿泄泻：应用加味厚朴温中汤治疗寒湿泄泻70例，与藿香正气口服液治疗64例作对照，疗程7日。以大便次数、量及性状恢复正常，伴随症状及体征消失，大便常规检查正常、细菌培养为阴性为痊愈标准。结果：治疗组总有效率91.42%，对照组85.93%。(《中医研究》2013年第3期)

2.功能性消化不良：应用厚朴温中汤治疗功能性消化不良67例，与多潘立酮片治疗67例作对照，疗程2周。以临床症状全部消失，经钡餐检查胃肠的蠕动功能转为正常为痊愈标准。结果：治疗组总有效率94.03%，对照组80.60%。(《中医临床研究》2011年第22期)

3.儿童功能性再发性腹痛：应用厚朴温中汤加味治疗儿童功能性再发性腹痛30例，与西沙比利治疗26例作对照，疗程7日，连续观察3个疗程。以经3个疗程治疗，所有症状消失并在3个月内无复发为治愈标准。结果：治疗组总有效率96.7%，对照组73.1%。(《浙江中医杂志》2009年第10期)

4.慢性胃炎：在常规西药治疗的基础上应用厚朴温中汤治疗慢性胃炎40例，与单纯西药治疗40例作对照，疗程4周。以临床症状消失，胃镜检查胃黏膜活动性炎症消失，病理组织检查基本正常，HP转阴为痊愈标准。结果：治疗组总有效率97.5%，对照组80%。(《中国中医药咨讯》2011年第16期)