临床主要用于治疗腹泻、功能性子宫出血、滑精自汗等病症。

1.顽固性腹泻：以加味赤石脂禹余粮汤治疗艾滋病合并顽固性腹泻患者56例。结果：临床治愈20例，好转30例，未愈6例，总有效率89.29%。(《中国中医基础医学杂志》2013年第7期)

2.功能性子宫出血(个案)：以赤石脂禹余粮汤加减治疗功能性子宫出血，患者病程4个月，冲任失司，山离其经，时时出血，以四乌贼骨一芦茹丸合赤石脂禹余粮汤为主方，重用赤石脂和禹余粮以收敛固涩止血，乌贼骨、茜草补血止血，配以凉血止血的地榆、贯众，辅以收涩止血的乌梅炭、仙鹤草、龟板，而补骨脂既用其收涩之性又取其温补肾阳达到于寒凉药中的反佐之功，出血很快得到了控制。(《中医药通报》2012年第4期)