- 上海交通大学医学院附属瑞金医院
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- 重点科室:消化内科、骨科、心血管内科、内分泌科、血液科、儿科消化专业、肾脏内科、皮肤科、神经内科、呼吸内科、普外科、烧伤科、感染科、肿瘤中心、中医肿瘤
- 复旦大学附属中山医院
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- 重点科室:神经内科、血管外科、普外科、心脏外科、肝外科、心内科、肝肿瘤内科、泌尿外科、骨科、中西医结合科、神经外科、眼科、耳鼻咽喉科、心超科、介入科
- 复旦大学附属华山医院
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- 重点科室:神经外科、手外科、泌尿外科、肾病科、心血管科、普外科、骨科、内分泌科、神经内科、中医专业(肺病)、皮肤科、泌尿外科、肾病科、消化科、肿瘤科、感染科
- 上海市肺科医院
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- 重点科室:肿瘤科、肺循环科、呼吸科、放疗科、结核科、中西医结合科、急诊科、职业病科、尘肺科、中毒科、胸外科、麻醉科、影像科、内镜科、超声科、核医学科
- 复旦大学附属儿科医院
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- 重点科室:新生儿科、小儿消化科、小儿外科、中医儿科、重症医学科、心血管科、传染病科
- 上海交通大学医学院附属仁济医院
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- 重点科室:消化内科,风湿免疫科,变态反应科,泌尿外科,生殖医学科,肾内科,神经外科,妇产科,普通外科
- 上海交通大学医学院附属第九人民医院
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- 重点科室:口腔临床医学、整复外科、骨科、口腔颌面外科、牙体牙髓科、牙周病科、口腔修复科、眼科、整复外科、口腔正畸科、口腔黏膜科、耳鼻喉科、内分泌科、麻醉科、泌尿外科
- 上海第六人民医院
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- 重点科室:内分泌代谢科、骨科、创伤骨科、耳鼻咽喉科、影像医学科、运动医学科、急诊医学科、骨外科学、心血管病、针推伤科、耳鼻咽喉科
- 上海长海医院
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- 重点科室:消化内科、泌尿外科、心血管外科、烧伤外科、中医肿瘤科、中医内科、中医外科、肛肠外科、神经外科、整形外科、心血管内科、血液内科、血管外科、耳鼻喉科、胸心外科、肿瘤科
- 上海交通大学医学院附属新华医院
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- 重点科室:心脏大血管外科、心血管内科、普外科、小儿内科、小儿外科、中医儿科、耳鼻咽喉-头颈外科、皮肤科、急诊医学科、小儿呼吸科
- 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
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- 重点科室:心血管专业、血液肿瘤专业、发育行为儿科、儿童重症医学科、儿童保健科、小儿外科
- 上海市第一人民医院
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- 重点科室:眼科、耳鼻喉科、呼吸科、泌尿外科、普外科、肿瘤科、妇科、心血管内科、临床药学、器官移植
- 上海交通大学医学院附属胸科医院
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- 重点科室:心血管内科、胸外科、心外科、呼吸内科
- 上海市公共卫生临床中心
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- 重点科室:妇产科学、传染病学